Фамилия Чуприан — редкая, и её происхождение неочевидно на первый взгляд. Чтобы разобраться, нужно сразу отбросить типовую модель с суффиксом -ов/-ев или -ин: в фамилии Чуприан нет ни одного из этих формантов. Перед нами не патроним (не «чей-то сын»), а цельное прозвище или имя, перешедшее в фамилию без изменений. Такое случается в южнорусских, украинских и белорусских говорах, где фамилии на согласный нередко фиксировали исходную форму: Сорока, Шевченко, Чуприан.

Самая вероятная основа — имя Чуприан, народный вариант канонического Киприан (от латинского Cyprianus — «кипрский»). В русской традиции имя Киприан часто искажалось в просторечии: Цыпрян, Куприян, Чуприян. Переход «к» в «ч» и смягчение — обычное дело для южнорусских и украинских говоров: ср. Чуприна (от Куприна), Чупрына. Так имя Киприан превращалось в Чуприан, а затем закреплялось как фамилия.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с прозвищем Чуприан от диалектного «чуприна» (вихор, чуб, хохол). В некоторых областях так называли человека с торчащими волосами или непослушной шевелюрой. Однако в таком случае логичнее ожидать фамилию Чупринов или Чупринин, а не Чуприан. Поэтому версия с именем выглядит крепче.

Географически фамилия тяготеет к западу и югу России, а также к Украине и Беларуси. Встречается в документах XVII–XVIII веков среди казаков и крестьян, где имя Киприан было распространено, а его просторечные формы — обыденны. Носитель фамилии Чуприан, скорее всего, потомок человека, которого в документах записали не по отцу, а по личному имени или прозвищу, что характерно для непривилегированных сословий.

Поскольку фамилия не получила массового распространения, её носители сегодня — это, вероятно, потомки выходцев из одного или нескольких близких регионов. Встретить Чуприана в Москве или Петербурге можно, но корни, скорее всего, ведут в чернозёмные области или на Украину.