Фамилия Чушенкова — женская форма фамилии Чушенков, и её разумнее рассматривать через мужской вариант, от которого она образована стандартным суффиксом -а. Основа фамилии — «Чушенк-», что сразу указывает на украинское или белорусское происхождение: суффикс -енк- (в русском произношении часто -енко) характерен для восточнославянских фамилий, особенно для территории бывшей Гетманщины и Слобожанщины. В русском языке этот суффикс мог адаптироваться в -енков, что и дало форму Чушенков.

Корень «чуш-» вызывает споры. Самое очевидное — связь с диалектным словом «чушка» (свинья, поросёнок) или «чушок» (небольшой поросёнок). В таком случае прозвище Чушенок мог получить человек, занимавшийся разведением свиней, или же обладатель какой-то внешней черты, напоминавшей поросёнка (например, курносый нос). В говорах южных областей России и Украины слово «чушка» употреблялось широко, и фамилия могла возникнуть именно там.

Вторая версия, менее вероятная, но встречающаяся в любительской ономастике, — связь с глаголом «чушить» (чесать, скрести) или «чушь» (вздор). Однако для прозвища, ставшего фамилией, значение «чесальщик» (льна, шерсти) возможно, но не подтверждено устойчивыми источниками. Более правдоподобно, что основа — «чуш-» от «чушка», и фамилия относится к «животным» прозвищам, распространённым у всех славян.

Географически фамилия Чушенков (и Чушенкова) чаще всего фиксируется в южных областях России (Ростовская, Волгоградская области, Краснодарский край) и на востоке Украины. Это объяснимо: суффикс -енк- типичен для украинской антропонимии, а после миграций XVIII–XIX веков носители таких фамилий расселились на Дон и Кубань. В центральной России фамилия встречается редко.

Социальный статус предков, скорее всего, был крестьянским или казачьим. Прозвище Чушенок не несёт дворянского оттенка — оно бытовое, из деревенского обихода. В ревизских сказках XIX века люди с такой фамилией числились государственными крестьянами или казаками. Никаких известных дворянских родов Чушенковых не зафиксировано.

В целом фамилия Чушенкова — пример типичной украинско-южнорусской модели, где прозвище (возможно, от «чушка») обрастало уменьшительным суффиксом -енк- и затем фамильным -ов. Носительница этой фамилии может с высокой вероятностью искать свои корни в среде малороссийского крестьянства или казачества.