Фамилия Данихно — яркий пример украинской модели фамилий на -но, которая характерна для Поднепровья и Левобережной Украины. По сути, это форма, образованная от имени или прозвища с помощью патронимического суффикса -енко, но в диалектном или упрощённом произношении потерявшая начальное «е». Если бы фамилия писалась в полной форме, она звучала бы как «Даниленко», что значит «сын Данилы». Но в быту, особенно в говорах Черниговщины, Полтавщины или Слобожанщины, «Даниленко» могло стянуться до «Данихно» — за счёт выпадения гласного и озвончения или отвердения согласного.

Основа фамилии — крестильное имя Даниил (в народной форме Данило), которое в переводе с древнееврейского означает «Бог — мой судья». На Руси имя было одним из самых распространённых, поэтому и производных фамилий от него десятки: Данилов, Данильченко, Данилюк, Данилевич. Данихно стоит в этом ряду особняком: редкий суффикс -хно (вместо обычного -енко) встречается в украинской ономастике, но не так часто. Он мог возникнуть из-за особенностей местного произношения или как вариант прозвищной модели (ср. фамилии Лихно, Михно, где -хно — от имени Михаил).

Географически фамилия тяготеет к восточной Украине и югу России. В переписях XIX века носители Данихно фиксировались в Харьковской, Екатеринославской губерниях, а также среди казачьего населения Кубани. Сословно это могли быть государственные крестьяне или казаки — фамилия не указывает на дворянское происхождение, так как суффикс -енко (и его вариант -хно) был типичен для непривилегированных слоёв.

Есть и менее вероятная версия: что корень не от имени, а от прозвища «Даниха» (так могли называть жену Данилы или хозяйку), а сын такой женщины получал прозвание «Данихин» или «Данихно». Но для украинской модели это нетипично: суффикс -енко почти всегда указывает на отчество, а не на матроним. Поэтому основная гипотеза — «сын Данилы» — остаётся самой надёжной.