Фамилия Данугян — яркий представитель армянских фамилий, образованных по модели с суффиксом -ян (в дореволюционных записях часто -янц, -янтс). Этот патронимический суффикс, восходящий к древнеармянскому -янц («из рода», «принадлежащий к»), превращает основу в указание на потомка определённого лица. В русской традиции фамилии на -ян склоняются не всегда, но в бытовом употреблении их часто адаптируют.

Основа фамилии — Дануг (арм. Դանուղ). Здесь возможны две версии происхождения, и обе укладываются в логику армянской антропонимии. Первая: Дануг — это вариант личного имени или прозвища, образованного от армянского слова «дануг» (арм. դանուղ), что означает «маленький топор», «тесло» (плотницкий инструмент). Прозвище мог получить человек, работавший с деревом — плотник, столяр, либо обладатель резкого, «рубящего» характера. Такие «инструментальные» прозвища (Топор, Молот, Пила) встречаются у многих народов, в том числе у армян, и часто становились основой фамилий.

Вторая версия, более редкая, но не исключённая: Дануг может быть диалектной или искажённой формой имени Дануш (от библейского Даниил — «Бог мой судья»). С потерей конечного -ш и заменой на -г (характерной для некоторых западных диалектов армянского языка) Дануш мог превратиться в Дануг. В таком случае фамилия Данугян означала бы «потомок Дануга» (то есть Даниила).

Географически фамилия Данугян, скорее всего, восходит к Западной Армении (территория современной Турции) или к армянским общинам Крыма, где встречаются фамилии с похожей фонетикой. В России фамилия редкая, встречается в основном в Краснодарском крае, Ростовской области и Москве — регионах с крупными армянскими диаспорами.

Известных носителей с фамилией Данугян, получивших широкую публичную известность, в открытых источниках не зафиксировано. Это типичная фамилия ремесленного или прозвищного происхождения, сохранившая память о конкретном предке — возможно, плотнике или человеке с острым языком.