Фамилия Докушев образована от имени или прозвища Докуш. Это краткая форма одного из полных христианских имён — скорее всего, Дормидонт или Досифей. В русской народной традиции такие «усечения» были обычным делом: длинные и непривычные для слуха имена сокращали до одного-двух слогов, чтобы легче было звать в быту. От Дормидонта оставался Докуша, от Досифея — Дока или Досюша, и в некоторых говорах конечное «ша» могло перейти в «куша». Так появилось прозвище, а затем и фамилия на -ев: Докушев, то есть «сын Докуша».

Вторая, менее вероятная версия, связывает фамилию с диалектным словом «докука» — назойливая просьба, хлопотное дело. Прозвище Докуша могли дать человеку навязчивому, беспокойному или, наоборот, тому, кто постоянно с кем-то хлопотал. Однако эта гипотеза слабее: суффикс -уш- в русских прозвищах чаще указывает на уменьшительно-ласкательную форму имени, а не на прямое свойство характера.

По модели образования фамилия Докушев относится к самому массовому типу русских фамилий — патронимическим на -ев. Они закрепились в основном в северных и центральных областях России, где была распространена форма отчества на -ов/-ев. В южных и западных регионах чаще встречались фамилии на -енко и -ук, так что география фамилии Докушев, скорее всего, связана с севером или средней полосой.

В документах фамилия встречается нечасто, что говорит о её относительной редкости. Среди однокоренных можно назвать Докукин, Докучаев, Докудовский — все они восходят к тому же корню «док-» и к разговорным формам имён или прозвищ. Социальный состав носителей был, скорее всего, крестьянским или мещанским: фамилии на -ев редко давали дворянам, у которых преобладали формы на -ский.