Фамилия Доминчен — редкий случай, когда угадываются сразу две возможные географии происхождения, и обе неочевидны. Первая версия ведет в Хорватию, к топониму Доминче — местечку неподалеку от города Корчула. Если предок носителя фамилии был выходцем оттуда, прозвище «Доминчен» закрепилось за ним по месту прежнего жительства. Такая модель образования фамилий от названий деревень и городов встречается у южных славян, и суффикс -ен указывает на принадлежность: «тот, кто из Доминче».

Вторая версия связывает фамилию с личным именем. Доминчен может быть вариантом написания фамилии Доминчин, а та, в свою очередь, образована от имени Доминка. Это уменьшительная или производная форма от целого ряда церковных имен: Доментиан (от латинского «Дометиев сын»), Доментий (в переводе — «укротитель»), Домн и Домнин (оба означают «господний», «божий»). В таком случае фамилия отчественная: Доминчен буквально значит «сын Доминки».

Словообразовательная модель здесь нестандартна для русских фамилий. Суффикс -ен (вместо привычного -ов/-ев или -ин) встречается в украинской и белорусской традициях, а также в фамилиях, принесенных переселенцами с Балкан. Это делает фамилию Доминчен скорее западно- или южнославянской по корням, чем великорусской.

Среди известных носителей — советский композитор и дирижер Климентий Яковлевич Доминчен. Его творческая биография подтверждает, что фамилия бытовала в культурной среде, хотя массово распространенной не стала. Разобраться, какая из версий верна для конкретной семьи, помогут архивные записи: если предки значились в документах как Доминчины или Доминченко, это склоняет чашу весов в сторону именной основы; если же в метриках встречается указание на выход из Австро-Венгрии или Хорватии — верен топонимический след.