Фамилия Дубинников — яркий пример того, как прозвище превратилось в родовое имя. В её основе лежит слово «дубина». В Древней Руси это прозвище было распространённым и не обязательно указывало на грубость или недалёкость. Чаще всего Дубиной называли человека высокого, крепкого, с мощным телосложением — этакого былинного богатыря. Реже прозвище давали упрямцу или тому, кто ходил с дубиной как с оружием или орудием труда.

Разбираем словообразовательную модель. Фамилия образована по цепочке: прозвище Дубина → отчество Дубинник → фамилия Дубинников. Суффикс «-ник» в основе «Дубинник» мог означать «сын Дубины» или, что менее вероятно, человека, имевшего отношение к дубинам (например, мастера, делавшего дубины, или того, кто ими торговал). А окончание «-ов» — классический русский патронимический суффикс, указывающий на принадлежность: «чей?» — Дубинников, то есть потомок Дубинника.

Интересно, что фамилия эта редкая: она стоит в одном ряду с такими же «длинными» формами, как Палкин, Топориков, Кнутов. Исследователь русских фамилий Б. Унбегаун в своих работах отмечал, что подобные трёхступенчатые модели (прозвище → отчество на -ник → фамилия на -ов) характерны для северных и центральных регионов России, где была сильна традиция называть человека по отцу с двойным суффиксом. Так что предки современных Дубинниковых, скорее всего, жили в этих краях.

Есть и альтернативная, но менее правдоподобная версия: фамилия могла возникнуть от топонима — названия деревни Дубинники или Дубинниково. Такие селения встречаются, но они, в свою очередь, тоже названы по прозвищу первопоселенца. Поэтому корень у фамилии один — прозвище Дубина, и несло оно в себе уважение к силе и стати, а не насмешку.