Фамилия Дубинянский образована от прозвища Дубина. В основе лежит нарицательное «дубина» — увесистая палка, но в переносном смысле так могли назвать человека не столько грубого, сколько прямолинейного, упёртого или, наоборот, простоватого. В старину прозвища такого рода не несли резко отрицательной окраски: «дубиной» могли окликнуть и того, кто отличался физической силой и крепким нравом. Со временем прозвище Дубина закрепилось за родом и перешло в фамилию, а затем, уже в форме Дубинянский, обрело характерный суффикс.

Суффикс -янск- в русских фамилиях обычно указывает на связь с местностью: по аналогии с названиями сёл (Дубино, Дубинино) или речек. Фамилии на -ский, как правило, носили дворяне и духовенство, но в случае с Дубинянским это не обязательно говорит о высоком сословии — в XIX веке такой суффикс могли присваивать и выходцам из крестьян, переселившимся в город, или семинаристам при поступлении в училище. Встречается также вариант Дубинянский с ударением на второй слог, что сближает её с польскими и украинскими фамилиями, где -аньский часто обозначало принадлежность к имению.

Географически фамилия привязана к западнорусским и малороссийским землям: она встречается в исторических документах среди мещан Волынской, Подольской и Киевской губерний. В современной России носители фамилии рассеяны, но наибольшая концентрация — в южных и центральных областях. Редкость фамилии делает её узнаваемой: по разным подсчётам, в России сегодня её носит не более нескольких сотен человек.