Фамилия Дудуева — женская форма фамилии Дудуев, и её происхождение напрямую связано с мужской основой. Сама фамилия Дудуев, скорее всего, образована от прозвища или личного имени Дудый или Дудуй. В русской ономастике суффикс -ев указывает на принадлежность («чей?»), то есть буквально «сын Дудуя» или «человек из рода Дудуя».

Корень «дуд-» в русских говорах многозначен. Во-первых, это «дудка» — музыкальный инструмент, и прозвище Дудка или Дудуй могли дать музыканту-дударю, пастуху, игравшему на дудке, или просто человеку с тонким, «свистящим» голосом. Во-вторых, в диалектах слово «дуда» означало «глуповатый, рассеянный человек» или «болтун» (ср. «дудеть» — надоедливо говорить одно и то же). В-третьих, у слова «дуда» есть значение «опухоль, шишка» — так могли прозвать человека с заметной физической особенностью.

Фамилия Дудуев имеет ярко выраженную региональную привязку. Она распространена на Северном Кавказе, особенно среди осетин и ингушей. В осетинском языке «дуду» — это детское слово, означающее «палец» или «рука», что могло стать домашним прозвищем. В ингушской среде фамилия (тайп Дудург, Дудуевы) входит в состав более крупных родовых объединений. Поэтому для носителей фамилии Дудуева из этого региона более вероятна связь с местными языковыми корнями, а не с русским инструментом.

Модель образования фамилии — типичная для русской среды (патроним на -ев), но основа могла быть заимствована из тюркских или кавказских языков. Например, у тюркских народов «дуду» — почтительное обращение к старшему или учителю. Таким образом, единого «правильного» значения нет: в каждом роду фамилия могла возникнуть независимо, от разных корней. Спор между версиями решается только генеалогическим исследованием конкретной семьи.