Фамилия Дуйко — один из примеров украинских фамилий, образованных от прозвища с помощью суффикса -ко. Этот суффикс в украинской ономастике выполнял роль уменьшительности или принадлежности, часто закрепляя прозвище за родом: Дуй → Дуйко, то есть «тот, кто происходит от Дуя» или просто «маленький Дуй». Такая модель особенно характерна для западноукраинских и подольских земель, где фамилии на -ко встречаются особенно часто.

Основа прозвища Дуй восходит к украинскому глаголу «дуйнути» — «надувать, раздувать», а также «побежать, броситься». Отсюда возможны два совершенно разных портрета предка. Первый — человек, связанный с работой, где требуется дуть: обработчик шкур, раздувающий меха, истопник, разжигающий горн, или мельник, управляющий потоком воздуха. Второй — человек, получивший прозвище за характер: трус, который «дует» прочь при опасности, или лентяй, убегающий от работы. Обе версии имеют право на существование, но первая (ремесленная) исторически более вероятна: прозвища по профессии давали чаще и они лучше закреплялись в фамилиях.

Встречается фамилия Дуйко и в польском контексте: польский глагол «dąć» (дуть) дал аналогичные прозвища, а суффикс -ко — типично восточнославянский, что указывает на украинское или белорусское происхождение конкретного носителя. В польских источниках фамилия фиксируется с XVI–XVII веков на землях современной Западной Украины и Подляшья.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Дуй, Дуйкин, Дуйков — показывает, что Дуйко стоит особняком: суффикс -ко не просто указывает на сына или потомка, но и сам по себе мог быть частью прозвища, данного человеку небольшого роста или с характерной манерой поведения. В словаре украинских фамилий Ю. Редько подобные формы разбираются как типичные для народной ономастики, где прозвище становилось наследственным именем рода без дополнительных изменений.

В современных базах данных Дуйко встречается преимущественно в западных областях Украины — Львовской, Тернопольской, Ивано-Франковской, а также среди украинской диаспоры в Канаде и США. В России фамилия редкая, но фиксируется в южных регионах, куда переселялись украинцы в XIX–XX веках.