Фамилия Джанайдарова — редкий пример фамилии, образованной от составного тюркского имени, где вторая часть — арабское заимствование. Основа «Джанай» (Джанайдар) восходит к двум корням: персидскому «джан» (душа, жизнь) и тюркскому «ай» (луна) либо «айдар» (петушиный гребень, чуб). Вторая версия связывает «Джанай» с титулом «дар» — «имеющий», «владеющий» (как в словах «хандар» — имеющий хана). Таким образом, исходное прозвище могло означать «обладатель живой души» или «тот, у кого чуб как у луны» — метафора красоты или мужественности.

Суффикс «-ова» указывает на принадлежность: Джанайдарова — жена или дочь Джанайдара. Фамилия закрепилась в среде тюркоязычных народов, особенно у казахов и татар, где составные имена с «джан» были распространены. Встречается также вариант Джанайдаров — без суффикса женского рода.

Географически фамилия тяготеет к западному Казахстану и Оренбуржью. В дореволюционных метрических книгах её носители фиксировались как «киргизы» (так тогда называли казахов) или «татары». Социальный слой — кочевники-скотоводы, реже — мелкие торговцы. Интересно, что в отличие от многих русских фамилий на «-ов», здесь суффикс не указывает на патроним (отчество), а скорее на родовую принадлежность: «из рода Джанайдара».

В ономастике фамилия неоднозначна. Словарь Б. Унбегауна не упоминает её напрямую, но модель «имя + дар» характерна для среднеазиатского ареала. Похожие фамилии — Джанаев, Джаналиев — имеют ту же основу «джан», но с разными формантами. Джанайдарова стоит особняком из-за редкого сочетания корней и суффикса, что делает её маркером смешанного тюрко-персидского влияния в антропонимии.