Фамилия Джангужина — яркий пример того, как русская модель фамилии на -ин(-а) накладывается на нерусскую основу. Здесь суффикс -ин (в женском роде -ина) указывает на принадлежность: «чей?» — «Джангужин», то есть потомок человека, которого звали или прозывали Джангужа. Основа фамилии тюркская, и её разбор требует обращения к языкам Поволжья, Приуралья или Средней Азии.

Скорее всего, в основе лежит тюркское имя или прозвище Джангужа, которое можно разложить на две части: «джан» (от персидского «джан» — душа, жизнь, близкий человек) и «гужа» (возможный вариант тюркского «кужа» или «кожа» — хозяин, господин, либо искажённое «ходжа» — учитель, наставник). Таким образом, Джангужа могло означать «господин души» или «дорогой хозяин» — ласковое или уважительное обращение к старшему, главе рода. В тюркских языках такие составные имена с компонентом «джан» встречаются часто, например, Джанбулат, Джанмирза.

География фамилии подсказывает её возможное происхождение. Фамилия Джангужина встречается преимущественно у татар, башкир и казахов, особенно в Оренбургской области, Башкортостане и Казахстане. Это указывает на то, что предки носителя фамилии могли быть из тюркоязычных кочевых или полукочевых групп, принявших православие (или сохранивших мусульманскую традицию, но получивших фамилию по русскому образцу при переписях). В Российской империи многие нерусские народы получали фамилии на -ов/-ев или -ин по отцу или деду, и Джангужина — типичный случай такой адаптации.

В отличие от распространённых фамилий на -ов, форма на -ин здесь не случайна: она часто присваивалась к основам, оканчивающимся на -а, -я. Джангужа — редкое имя, почти не встречающееся в современных документах, что делает фамилию уникальной. Сравните с более частыми однокоренными вариантами: Джангуразов, Джангулов — они показывают, как менялся второй компонент основы.

Таким образом, фамилия Джангужина хранит память о предке, которого в его общине называли уважительным тюркским прозвищем, а позже, при записи в метрики, это прозвище закрепилось за его потомками в русской грамматической форме.