Фамилия Джаперов — редкий случай, когда внешне «восточная» основа на поверку оказывается связана с русской ономастической традицией. В ней сочетаются два пласта: тюркское или кавказское происхождение корня и типично русский патронимический суффикс -ов. Это указывает, что фамилия формировалась на территории, где русское административное влияние (или православное крещение) накладывалось на местные имена и прозвища.

Самый очевидный путь разбора — от имени Джапер. В тюркских языках, особенно в карачаево-балкарском, кумыкском или ногайском, имя Джапар (вариант — Жапар) восходит к арабскому Джафар — «ручей», «источник», «маленький ручей». Фонетическая замена «ф» на «п» — обычное дело в тюркской речи, где звук «ф» часто заменяется на «п» или «б». Так арабский Джафар превращается в Джапар, а затем, при русификации, получает суффикс -ов: Джаперов, то есть «сын Джапера».

Менее вероятная, но возможная версия — от прозвища Джапер, связанного с диалектным глаголом «джапать» (в некоторых говорах — хватать, брать, или, наоборот, бить, шлёпать). Однако, учитывая географию фамилии — она встречается в Дагестане, Чечне, среди астраханских ногайцев и у татар, — тюркское арабское происхождение намного правдоподобнее. Если бы корень был исконно русским, фамилия бытовала бы в центральных областях, чего не наблюдается.

Интересная деталь: в русской письменности фамилия могла записываться на слух по-разному. Вариант Джаперов — это адаптация, где мягкое «е» смягчило согласный. В дореволюционных метрических книгах можно встретить написание Джапаров — с открытым «а» во втором слоге, что ближе к исходному имени. Такая вариативность — типичный след устной передачи фамилии при переходе из одной языковой среды в другую.

Социально предки Джаперовых, скорее всего, были свободными крестьянами или узденями (дворянами) на Северном Кавказе, принявшими русскую фамилию при учёте в казачьи войска или при переходе в православие. Фамилия не несёт оттенка служилого сословия (суффикс -ов универсален), а её редкость говорит о том, что род не был многочисленным или широко рассеянным. Сегодня носители фамилии сосредоточены в основном на юге России и в Поволжье.