Фамилия Джинибалаян звучит непривычно для русского уха, и это прямой ключ к её происхождению. Она пришла из армянской ономастики, о чём говорит характерный суффикс -ян, один из самых распространённых фамильных показателей у армян. В армянском языке суффикс -ян (или -янц) восходит к древнему -янц, означавшему принадлежность к роду, и выполняет ту же роль, что русское -ов или грузинское -дзе: «из рода такого-то», «потомок такого-то». Таким образом, Джинибалаян — это «потомок Джинибала» или «из рода Джинибаловых».

Сложнее с основой «Джинибал». Здесь, скорее всего, мы имеем дело с составным именем или прозвищем. Первая часть, «Джини», может быть искажением армянского имени Дживан (Дживан — «живая душа» или «молодой») или восходить к персидскому слову «джан» (душа, жизнь), часто используемому в армянских составных именах как ласкательный компонент. Вторая часть, «Бал», в армянском языке имеет два возможных значения. Первое — «бал» как «вишня»; в этом случае прозвище могло относиться к человеку с румяным лицом или занимавшемуся садоводством. Второе значение — «бал» как диалектное или устаревшее слово, означающее «беда», «несчастье»; тогда Джинибал могло быть охранительным именем, которое давали ребёнку, чтобы отвести от него зло (по принципу «плохое имя — плохая судьба для злых духов»). Вряд ли это напрямую связано с тюркским «бал» (мёд), хотя заимствования в армонской лексике встречаются, но для фамилии на -ян тюркская основа менее характерна.

Географически фамилия Джинибалаян редкая и, по всей видимости, локализована. Она могла возникнуть в одной из армянских областей исторической Западной Армении (ныне территория Турции) или среди армянской диаспоры, например, в Иране или Ливане, где сохранялись старые родовые прозвища. В России эта фамилия встречается единично, чаще всего у потомков армян, переселившихся в XIX–XX веках. Сословно носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками, так как сложное прозвище редко встречалось у армянской знати, носившей фамилии на -янц с указанием на княжеский род. Таким образом, Джинибалаян — это «вишнёвый» или «живой-вишнёвый» потомок с охранительным оттенком, что делает её уникальным маркером конкретной семейной истории, а не массовой фамилией.