Фамилия Джубабо звучит настолько экзотично для русского уха, что сразу понятно: её корни — не в славянских языках. Это яркий пример фамилии, которая попала в русский обиход из регионов Северного Кавказа или Закавказья, скорее всего, из Абхазии. Основа фамилии — личное имя или прозвище Джубабо, которое в абхазском языке может означать «медвежонок» или «медвежий детёныш». В абхазской антропонимике имена, образованные от названий зверей, не редкость: они служили оберегами или указывали на силу, мощь и выносливость.

Словообразовательная модель фамилии проста и типична для абхазских фамилий: к основе Джуба- добавляется суффикс -бо. В абхазском языке суффикс -бо часто образует фамилии или указывает на принадлежность к роду. В русском контексте фамилия Джубабо не получила дополнительных славянских суффиксов вроде -ов или -ин, а сохранила свою исходную форму, что бывает, когда носители переселялись в русскоязычную среду относительно поздно, в XIX–XX веках, и фамилия уже закрепилась в документах без изменений.

Предки человека с фамилией Джубабо, скорее всего, жили в горной или предгорной местности Абхазии, занимались скотоводством или земледелием. Прозвище «медвежонок» могло закрепиться за основателем рода из-за его физической силы, коренастого телосложения или, наоборот, как ласковое имя для младшего ребёнка. В целом фамилия редкая, и её носители в России, как правило, имеют абхазские или, реже, адыгские корни. Встретить её в центральной России почти невозможно, а на Кавказе она указывает на принадлежность к определённому роду или селу.