Фамилия Джубанышкалиев — пример редкой сложносоставной фамилии, в которой переплелись несколько тюркских корней. Её основа явно разбивается на две части: «Джубаныш» и «Кали». Первая часть, «Джубаныш», скорее всего, восходит к тюркскому имени или прозвищу, образованному от глагола со значением «утешать», «успокаивать». В казахском, киргизском и других тюркских языках есть имя Жұбаныш (Джубаныш), которое означает «утешение», «отрада». Вторая часть, «Кали», — это вариант имени Кали, которое в свою очередь является сокращённой формой от арабского имени Калим (Галим) или Калимулла, что значит «знающий», «учёный» или «обладающий знанием». Таким образом, всё имя Джубанышкали можно перевести как «утешение (отрада) знающего» или «утешитель, данный Кали».

Словообразовательная модель фамилии — типично тюркская с русским суффиксом принадлежности. К основе «Джубанышкали» добавили русский патронимический суффикс «-ев», который в тюркских фамилиях часто заменяет исконные окончания. Это указывает на то, что фамилия оформилась уже в русской административной среде, скорее всего, в XIX — начале XX века, когда у казахов, киргизов и других народов начали фиксировать фамилии по отцовскому имени. Носитель фамилии — потомок человека по имени Джубанышкали, где два имени слились в одно.

Географически фамилия Джубанышкалиев встречается почти исключительно в среде казахского и киргизского населения, особенно в западных и южных регионах Казахстана, а также в приграничных районах Киргизии. Встречаемость крайне низкая, что делает фамилию локальной и родовой. Скорее всего, предки носителя были скотоводами или земледельцами, а само имя дали ребёнку, родившемуся в трудное время как «утешение» для семьи.

Интересная деталь: в написании фамилии встречаются варианты «Джубанышев» или «Жубанышкалиев» (с буквой Ж в начале). Первый вариант — более русифицированный, где отсекли вторую часть имени, второй — более точный с точки зрения тюркской фонетики. Джубанышкалиев — это тот редкий случай, когда фамилия сохранила полную форму двусоставного личного имени, что делает её ценным источником для историков и генеалогов.