Фамилия Джубанышева — женская форма фамилии Джубанышев, и чтобы понять её происхождение, нужно разобрать мужской вариант. Основа здесь — тюркское личное имя Джубаныш. В казахском, киргизском, каракалпакском и других тюркских языках имя Джубаныш (Жубаныш) означает «радость», «отрада». Скорее всего, так родители назвали долгожданного, позднего или единственного ребёнка — того, кто стал утешением и счастьем для семьи.

Модель образования фамилии типична для русского делопроизводства на территориях с тюркским населением. К основе Джубаныш добавили русский патронимический суффикс -ев (после шипящего «ш» пишется «ев», а не «ов»). Окончание -а указывает на принадлежность женщине. Так фамилия Джубанышева буквально значит «дочь или жена человека по имени Джубаныш».

Географически фамилия чаще всего встречается среди казахов, особенно в западных и южных регионах Казахстана, а также у киргизов. В России носители фамилии живут в основном в Оренбургской, Астраханской областях и в республиках Северного Кавказа, куда фамилия попала в ходе миграций.

Любопытная деталь: в дореволюционных документах фамилию могли записывать иначе — Джубанышевъ, иногда с буквой «ы» после «ж»: Джубанышев, но встречается и более русифицированный вариант Жубанышев. Вторая форма точнее передаёт звучание оригинала, где первая буква — мягкий твёрдый звук «ж». Однако написание через «джу» закрепилось под влиянием русской орфографической традиции, где «джу» передаёт тюркский звук «ж».

Сословно предки носительницы фамилии, скорее всего, были кочевниками-скотоводами или вольными общинниками, не принадлежавшими к дворянству. Фамилия не княжеская и не родовая в аристократическом смысле — она бытовая, образованная от личного имени, и говорит о том, что в роду ценили радость, которую принёс ребёнок.