Фамилия Джусаев принадлежит к числу тех, чью основу нужно искать не в славянских, а в тюркских языках. В русской среде она оформлена по классической модели с суффиксом -ев, который присоединяется к основам, оканчивающимся на мягкий согласный или гласный. В данном случае суффикс добавлен к имени или прозвищу Джусай, которое и стало ядром фамилии.

Само имя Джусай — это тюркская форма, восходящая к арабскому имени Йусуф (Юсуф). В тюркских языках, особенно в казахском, киргизском, ногайском и каракалпакском, начальный звук «й» часто переходит в «дж» или «ж». Так арабский Юсуф (библейский Иосиф) превратился в Жусуп или Джусуп, а производная форма с аффиксом -ай (указывающим на ласкательность или уменьшительность) дала имя Джусай. Буквально его можно перевести как «маленький Юсуф» или «Юсуфчик».

География фамилии Джусаев довольно прозрачна: она распространена прежде всего среди народов Северного Кавказа (ногайцы, кумыки) и в Центральной Азии (казахи, киргизы). В России носители фамилии чаще всего встречаются в Ставропольском крае, Астраханской области и Дагестане — регионах с компактным проживанием ногайцев. Встречается она и у казахов, где ударение обычно падает на последний слог: Джуса́ев.

Таким образом, предок современного Джусаева с высокой вероятностью был человеком по имени Джусай — тюркским вариантом имени Иосиф. Фамилия не указывает прямо на род занятий или сословную принадлежность, но говорит о культурной и языковой среде, из которой вышли её первые носители. Это типичная патронимическая фамилия, образованная от личного имени отца, и в этом смысле она ничем не отличается от тысяч других отчеств, превратившихся в фамилии.