Фамилия Эбзеев образована от прозвища Эбзе. Оно берет начало от существительного «эбзе». Так балкарцы называют сванов. Сваны являются субэтнической группой грузин. Они проживают в Местийском и Лентехском районах Грузии, которые объединяются в историческую область Сванетию. Вероятно, именование Эбзе отражает этническую принадлежность его обладателя. Так могли назвать того, кто относился к сванам. Среди известных однофамильцев можно назвать президента Карачаево-Черкесской республики, доктора юридических наук, профессора Бориса Сафаровича Эбзеева. Таким образом, потомок человека, которого звали Эбзе, со временем получил фамилию Эбзеев.