Фамилия Едигенов — редкий случай, когда основа почти наверняка не славянская, а тюркская, но при этом сама модель образования — чисто русская, с суффиксом -ов. Это значит, что предок носителя фамилии, скорее всего, жил в среде, где русские фамилии давали по отцу или прозвищу, но само прозвище имело тюркские корни.

Разбираем основу. «Едиген» — это, с высокой вероятностью, вариант имени или прозвища Едигей. Едигей — историческая фигура, бек Золотой Орды конца XIV — начала XV века, основатель Ногайской Орды. В тюркских языках «еди» значит «семь», а «гей» или «ген» может восходить к слову со значением «герой», «богатырь» или «владыка». Таким образом, имя Едигей переводится примерно как «семь героев» или «семь владык» — возможно, имелось в виду, что человек обладает силой семерых. У башкир, татар, казахов и ногайцев имя Едигей (Едиге) встречается до сих пор, и в прошлом его нередко давали мальчикам.

Фамилия Едигенов могла возникнуть двумя путями. Первый, прямой: у человека по имени Едигей (в русской записи Едиген) родился сын, которого в документах записали как «Едигенов сын» — то есть «сын Едигена». Второй: прозвище Едиген мог получить человек, которого сравнивали с легендарным военачальником — за силу, лидерство или воинскую доблесть. Такие прозвища часто давали в казачьей среде или среди служилых татар, позже переходивших в русское сословие.

Суффикс -ов указывает на то, что фамилия оформилась в центральной России или на южных рубежах, где шло активное смешение русского и тюркского населения. Географически фамилия Едигенов встречается в Поволжье, на Урале и в Оренбуржье — в регионах, где исторически жили башкиры, татары и казахи, переходившие в православие или вступавшие в казачьи войска. Встречаются Едигеновы и среди астраханских татар.

Словообразовательный нюанс: в фамилии не типичный для тюркских заимствований суффикс -ин (как в фамилиях Ахметшин, Хайруллин), а именно -ов. Это говорит о том, что основа адаптировалась под русскую патронимическую модель ещё в XVII–XVIII веках, когда фамилии на -ов стали массово закрепляться за нерусским населением. Если бы фамилия возникла позже, она могла бы звучать как Едигеев.

Версия о происхождении от калмыцкого или монгольского «эдген» («хозяин», «владелец») менее вероятна: в русских документах фамилия фиксируется именно с тюркской огласовкой «еди», что отсылает к имени Едигей.