Фамилия Ефрим образована напрямую от мужского имени Ефрим — украинско-белорусской народной формы канонического имени Ефремий. В русской традиции это имя давали в честь одного из святых покровителей: в святцах известны святитель Ефрем Печерский, преподобный Ефрем Сирин, святитель Ефрем Новоторжский и другие. Исходное древнееврейское имя Эфрайим означает «плодовитый», «растущий».

В отличие от фамилий на -ов или -ин, которые образуются от отчества с притяжательным суффиксом, здесь мы имеем редкую модель — фамилия совпадает с самим именем без добавочного оформления. Такое «голое» имя в роли фамилии чаще встречается в западнорусских землях, а также у украинцев, белорусов и в еврейских общинах. География бытования фамилии Ефрим широка: её фиксируют не только на Украине и в Белоруссии, но и в Румынии, Молдавии.

Точное время и место возникновения фамилии установить сложно: процесс закрепления имени за родом шёл постепенно и в разных регионах с разной скоростью. Ясно одно: основатель рода носил имя Ефрим, и оно перешло к потомкам как родовое прозвание — без суффиксов, без изменений, в той форме, в которой его произносили в быту.