Фамилия Элексе — редкий случай, когда русская по форме фамилия имеет явно нерусское, скорее всего, финно-угорское или прибалтийское происхождение. Она образована по модели, типичной для северных регионов России, где в XVI–XVII веках активно смешивались русские, карельские, вепсские и финские роды. Основа фамилии — личное имя или прозвище Элексе, которое представляет собой местную форму от канонического имени Алексей. В диалектах русского Севера и в прибалтийско-финских языках имя Алексей нередко усекалось и звучало как Элекса, Элексей, а в родительном падеже — Элексе. Фамилия закрепилась в форме родительного падежа без суффикса, что нехарактерно для классических русских фамилий на -ов/-ев или -ин. Такая модель (Элексе, а не Элексеев) встречается в олонецких и архангельских говорах, а также в среде карелов-ливвиков и вепсов, где фамилии часто фиксировали имя отца в родительном падеже без дополнительного оформления. Таким образом, Элексе буквально значит «сын Элексы» или «из рода Элексы». Носитель фамилии, скорее всего, происходил из крестьян или ремесленников Олонецкой губернии, Карелии или западного Поморья. Встречаются единичные упоминания этой фамилии в метрических книгах Вытегорского уезда XIX века, что подтверждает её северную привязку. Ошибочно относить фамилию к западноевропейским, например французским, — в русском контексте она не имеет отношения к французскому «élégance» или имени Alexis.