Фамилия Эмирусейнов — яркий пример того, как в русской фамильной модели закрепилось сложное арабское имя с тюркскими корнями. Разобрать её стоит не с корня, а с суффикса: окончание -ов указывает, что перед нами классическая русская патронимическая фамилия, то есть «чей-то сын» или «чей-то потомок». Основа же — Эмирусейн — это имя, которое в бытовом употреблении передавалось из поколения в поколение.

Само имя Эмирусейн — составное. Первая часть, «Эмир», восходит к арабскому amīr — «повелитель, князь, военачальник». В тюркских языках это слово стало распространённым компонентом имён, часто указывая на знатность или желаемое положение. Вторая часть, «усейн», — это тюркская или дагестанская форма арабского имени Хусейн (от арабского «хороший, красивый»). Хусейн — имя внука пророка Мухаммеда, чрезвычайно почитаемое в исламе. Таким образом, полное имя Эмир-Хусейн (или Эмирусейн) означает «повелитель Хусейн» или «князь Хусейн» — типичное для мусульманского Востока составное имя, где первая часть служит эпитетом или пожеланием величия.

Географически фамилия Эмирусейнов почти наверняка ведёт в Дагестан, где широко распространены имена с компонентом «Эмир» и где аварский, лезгинский, даргинский языки легко адаптируют арабские имена. Встречается она и у других народов Кавказа, но дагестанское происхождение — самое вероятное. В русской среде фамилия появилась, скорее всего, в XIX–XX веках, когда при переписях и паспортизации горцам давали фамилии по имени отца с русским суффиксом -ов.

Редкость фамилии в том, что она сохранила полную форму составного имени без усечения, в отличие от более частых вариантов вроде Усейнов или Эмиров. Носитель такой фамилии — потомок человека, которого звали Эмирусейн, и это имя подчёркивало его родовую связь с исламской традицией и, возможно, с уважаемым в обществе статусом.