Фамилия Эмишян — яркий пример армянской модели фамилии, образованной с помощью патронимического суффикса -ян (вариант -янц). В армянском языке этот суффикс означает «из рода такого-то» или «принадлежащий», то есть Эмишян — буквально «из рода Эмиша». Основа фамилии — личное имя Эмиш, которое само по себе требует разбора.

Имя Эмиш, скорее всего, тюркского происхождения и восходит к слову «эмиш» (emış) — причастию от глагола «емек» (есть, кушать) в значении «съеденный, поеденный». В тюркских языках это слово могло использоваться как охранительное имя: в древности считалось, что имя с негативным оттенком отпугнет злых духов и убережет ребенка от болезней. Подобная практика встречается у многих народов — назвать ребенка «Плохишом» или «Неудачником», чтобы он вырос здоровым и счастливым. Таким образом, Эмиш — это имя-оберег, которое со временем стало основой для фамилии.

Другая, менее вероятная версия связывает имя Эмиш с арабским «амиш» (друг, товарищ) или с персидским «амиш» (смешанный, перемешанный). Однако тюркская этимология выглядит более убедительной, учитывая многовековое соседство и взаимовлияние армянского и тюркского миров в Закавказье.

Фамилия Эмишян распространена среди армян, чьи предки жили в регионах с сильным тюркским влиянием — например, в Западной Армении (территории современной Турции) или в Нагорном Карабахе. Встречаются также варианты написания: Эмишьян (с твердым знаком) и Эмишянц (с более архаичным суффиксом). Носители фамилии сегодня живут в Армении, России, США и Франции — в странах армянской диаспоры. Сословно предки Эмишянов могли быть кем угодно: крестьянами, ремесленниками или купцами, — фамилия не содержит указания на социальный статус, а только на родовую принадлежность.