Фамилия Эндакова — женская форма фамилии Эндаков, и её разбор стоит начать с суффикса. Модель на -ов/-ев (в женском роде — -ова/-ева) — самая массовая в русском ономастиконе: она указывает на принадлежность, отвечая на вопрос «чей?», то есть Эндаков — это потомок человека по прозвищу или имени Эндак.

Ключ к фамилии — основа «Эндак». Это слово не из общеупотребительной русской лексики, и здесь есть две основные версии происхождения. Первая, наиболее вероятная: Эндак — это вариант тюркского имени или прозвища. В тюркских языках корень «энд-» / «анд-» может означать «клятва», «обет» (ср. древнетюркское «ант» — клятва). Имя Андак или Эндак могло даваться ребёнку, рождённому после даваемого родителями обета, или человеку, известному своей верностью слову. В русских говорах, особенно в регионах с татарским и башкирским влиянием (Поволжье, Урал), такие имена легко переходили в прозвища, а затем в фамилии.

Вторая, менее распространённая версия, связывает фамилию с диалектными словами. В некоторых северных и сибирских говорах «эндак» или «ендак» могло быть искажённым произношением слова «яндак» — так называли плохую, захудалую вещь или неказистого человека (от тюркского «яман» — плохой). Однако эта версия менее убедительна, так как прозвище с явно негативным значением редко становилось основой для фамилии, не претерпев изменений.

Географически фамилия Эндаков (и Эндакова) встречается не повсеместно. Основной ареал — Удмуртия, Татарстан, Кировская и Пермская области. Это как раз зона активного русско-тюркского пограничья, что подтверждает первую, «тюркскую» версию. Суффикс -ов указывает, что фамилия сформировалась уже в русской среде, когда носитель тюркского имени или его потомок получил стандартное русское фамильное окончание.

Таким образом, Эндакова — это фамилия, корни которой уходят в тюркскую антропонимию, и её носители, скорее всего, происходят из крестьян или служилых людей, живших в зоне контакта с тюркскими народами. Фамилия недвусмысленно говорит о том, что предок был человеком, чьё имя или прозвище было связано с понятием клятвы, обета.