Фамилия Ендернейт — редкий случай для русского ономастикона. Она не вписывается в привычные модели на -ов, -ин или -ский, а её звучание и корень выдают в ней не славянское, а немецкое происхождение. Скорее всего, перед нами фамилия, принесённая в Россию переселенцами из Германии, Австрии или Швейцарии, которых в XVIII–XIX веках приглашали осваивать Поволжье, Новороссию и другие земли.

Основа фамилии — немецкое слово или имя. Самый вероятный вариант: сложное слово, образованное от «Ende» (конец) и «Neit» или «Neid» (зависть, вражда). В буквальном прочтении это могло быть прозвищем вроде «тот, кто кладёт конец вражде» или, наоборот, «крайний в споре». В немецких диалектах «Neit» могло означать и «гнев», «досаду», что придаёт фамилии оттенок характера предка — возможно, вспыльчивого или принципиального человека.

Вторая версия, менее распространённая, но имеющая право на существование: фамилия восходит к топониму. В Германии есть несколько крошечных поселений с корнем «Ender» (например, Эндерсдорф), а суффикс -ейт мог возникнуть из диалектного произношения. Переселенцы нередко брали фамилию по названию родной деревни, искажённому на русской почве.

Окончание -ейт — не суффикс в привычном для русских фамилий смысле, а часть немецкой основы, которая при адаптации осталась без изменений. В отличие от фамилий колонистов, которые часто русифицировали (Миллер, Шмидт, Фишер), Ендернейт сохранил почти оригинальное звучание. Это говорит о том, что носители фамилии, вероятно, долго жили в компактных немецких общинах, где язык и письменность передавались без сильного влияния русского окружения.

Сословно предки Ендернейт, скорее всего, были крестьянами-колонистами или ремесленниками. В списках поселенцев Поволжья и Причерноморья встречаются единичные записи с такой фамилией, но массового распространения она не получила. Сегодня носители фамилии рассеяны по всей России и странам бывшего СССР, но их немного — фамилия остаётся штучной, почти не встречающейся за пределами семейной памяти.