Фамилия Енсаева образована от мужского имени Енсай — а это имя, в свою очередь, скорее всего, восходит к казахскому или башкирскому мужскому имени Енсай, что означает «широкий, просторный ручей» (ен — «ширина», сай — «овраг, ручей»). В тюркской ономастике такие «географические» имена были распространены: они не столько описывали характер, сколько желали ребёнку удачной доли, связывая его с природным раздольем и плодородием.

Модель образования фамилии — типичная для русского восприятия тюркских имён: к основе Енсай добавили русский суффикс принадлежности -ев, а затем нарастили женское окончание -а. То есть фамилия Енсаева — это буквально «дочь (или жена) Енсая». Мужской вариант — Енсаев — сохранился в тех же семьях, но в документах чаще фиксируется женская форма, если речь идёт о носительнице.

Географически фамилия редкая, встречается в основном в Оренбургской области, Башкортостане и на юге Челябинской области — в зоне исторического расселения башкир и казахов, где русские фамилии на -ев часто закреплялись за местным населением при переписях. Встречаются отдельные записи в Татарстане, но там более типичны формы на -ов.

Интересная деталь: в некоторых архивных записях XIX века фамилию писали как Енсаева (с двумя «с»), что отражает двойное произношение в местных говорах — «Енсаев» и «Енссаев». Такое колебание в написании подтверждает, что фамилия не книжная, а народная, записанная со слуха.