Фамилия Енюковы (в мужском варианте — Енюков) — это отчество, которое прошло несколько стадий формирования. В её основе лежит имя Енюк, а оно, в свою очередь, — краткая, обиходная форма от просторечного имени Еникей. Еникей — это народная переработка церковного мужского имени Евникиан (или Евникей), которое пришло из греческого языка и означает «добропорядочный».

Есть и вторая версия происхождения: имя Еникей могли образовать от имени Ианикит (в просторечии — Аникита, Аника). С греческого оно переводится как «непобедимый». Чередование гласных а/е в корне (Аника — Еникей) объясняется влиянием местных говоров и диалектов русского языка, где звуки могли меняться под ударением или в безударной позиции.

Словообразовательная модель фамилии заслуживает отдельного внимания. Суффикс -юк в фамилии Енюков — довольно редкий для центральной России признак. Чаще всего он указывает на западно-украинское или белорусское происхождение. В таком случае фамилию можно прочитать как отчество второго порядка: Енюков — это «сын Енюка, внук Ени». То есть первоначальное имя Еня (сокращение от Еникей) дало форму Енюк («маленький Еня» или «сын Ени»), а уже от неё образовалась фамилия, отвечающая на вопрос «чей?» — Енюков.

Точное место и время возникновения фамилии установить сложно: процесс становления фамилий на Руси растянулся на несколько столетий, а фамилии с уменьшительными суффиксами могли закрепиться как в XVI, так и в XIX веке. Можно с уверенностью сказать, что этот пример — не просто случайный набор суффиксов, а характерный памятник славянской антропонимии, где имя, прозвище и указание на родство сплелись в одну устойчивую форму.