Фамилия Эпельимов — редкий случай в русском ономастиконе, где необычное звучание сочетается с прозрачной, но неочевидной словообразовательной логикой. Первое, что бросается в глаза, — суффикс -имов. В русских фамилиях он встречается редко, чаще всего в вариантах на -им (например, Галим, Карим) или -имов от тюркских и арабских имён. Однако основа «Эпель» не похожа на тюркскую или арабскую лексику. Скорее всего, перед нами фамилия, возникшая из прозвища или имени, адаптированного через еврейскую или немецкую языковую среду.

Вероятнее всего, в основе лежит имя Эпель — вариант библейского имени Авель (в русской традиции — Авель, в идише — Эвель, Эпель). Усечённая форма «Эпель» могла бытовать в среде восточноевропейских евреев, а затем, при переходе в русскую среду, к ней добавили типичный русский патронимический суффикс -имов (по аналогии с фамилиями от имён на -а: Абрам → Абрамов, но Эпель → Эпельимов). Вторая версия, менее вероятная, — связь с немецкой фамилией Eppel (от яблока, Apfel) или топонимом Эппель (земля Гессен), но тогда форма была бы Эппелев или Эппельман, а не Эпельимов.

Географически фамилия тяготеет к регионам бывшей черты оседлости (Украина, Белоруссия, южные губернии России), где еврейские фамилии часто русифицировали через суффиксы -ов/-ев. Редкость фамилии объясняется тем, что основа «Эпель» не попала в массовые списки, а осталась локальным вариантом. Таким образом, предки носителя фамилии Эпельимов, скорее всего, были евреями, носившими имя или прозвище Эпель (Авель), а их потомки при получении официальной фамилии в XIX веке получили форму на -имов, которая закрепилась в документах.