Фамилия Эпоева — женская форма фамилии Эпоев, и её разбор стоит начать с суффикса. Типичная русская модель на -ов/-ев указывает на происхождение от мужского личного имени или прозвища Эпой. В основе лежит корень «эп-», который в русском языке не имеет прямого значения, но встречается в диалектной лексике. В северных и сибирских говорах «эпа» или «эпой» могли называть нелюдимого, угрюмого или странного человека — отсюда и прозвище, которое затем закрепилось как фамилия. Есть и другая, менее вероятная версия: связь с тюркским корнем «эп» (ловкий, умелый) — в таком случае фамилия могла возникнуть у народов Поволжья или Приуралья, где русские фамилии нередко образовывались от местных прозвищ.

География фамилии Эпоева довольно узкая. По данным открытых источников, основная масса носителей сосредоточена в Республике Северная Осетия — Алания, а также в соседних регионах Кавказа. Это наводит на мысль, что фамилия могла быть русифицированной формой осетинской фамилии. В осетинском языке есть слово «æпп» (ровный, плоский) или «æппа» (отец, старший), но прямое соответствие «Эпоев» неочевидно. Скорее всего, фамилия прошла через русскую документацию: осетинское родовое имя или прозвище записали по русской модели с суффиксом -ов, что характерно для XIX века, когда горцев массово вносили в метрики.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ев присоединили к основе «Эпой». Ударение, судя по распространённому произношению, падает на второй слог: Эпо́ева. Встречаются варианты написания с одной «о» (Эпоева) — это нормативно, хотя в дореволюционных записях могло быть через «а» (Эпаева) из-за акающего произношения. Сословно фамилия не элитарная: в списках дворянских родов она не значится, а её носители — скорее крестьяне или казаки, получившие фамилию по прозвищу предка.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Эпов, Эпин, Эпкин — показывает, что все они редки и имеют общую основу. Эпоева выделяется суффиксом -оев, который типичен для фамилий, образованных от имён на -ой (ср. Толстой — Толстоев). Таким образом, фамилия Эпоева — это не просто «дочь Эпоя», а указание на принадлежность к роду человека, которого в своё время прозвали за характер или внешность, а позже запись закрепила это прозвище в официальной форме.