Фамилия Епутатов, вероятно, представляет собой фонетический вариант фамилии Депутатов, которая происходит от прозвища Депутат. В старину так называли выборного, поверенного от правительства или от общества, для наблюдения за ходом дела, или для принесения просьбы, поздравления, благодарности и пр. Таким образом, фамилия Депутатов может указывать на род занятий, социальное положение основателя рода. Однако также нельзя исключить, что фамилию Депутатов получил не сын депутата, а его рабочий, батрак или крепостной крестьянин, записанный при регистрации депутатовым, т. принадлежащим депутату. Фонетические изменения в основе фамилии, вероятнее всего, связаны с просторечной формой слова «депутат» - «епутат». Так и прозвище Епутат закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Епутатов.