Фамилия Эрганян — армянская по происхождению, и её разумнее всего рассматривать в контексте армянской ономастики, а не русской. В русском языке она закрепилась как вариант передачи армянской фамилии, но её внутреннее устройство подчиняется законам армянского словообразования.

Основа фамилии — Эрга (или Эрган). В армянском языке суффикс -ян (или -янц) — самый распространённый патронимический показатель, аналог русского -ов/-ев. Он означает «принадлежащий к роду» или «потомок такого-то». То есть Эрганян — это «из рода Эргана». Если же исходная форма была Эргян, то суффикс -ан мог быть наращён для благозвучия или в результате диалектных особенностей.

Что могло лежать в основе имени или прозвища Эрган? Самая вероятная версия — тюркское или персидское заимствование. Слово «эрга» (или «эрке») в тюркских языках означает «нежный», «изнеженный», «балованный», иногда «свободный». В армянской среде, особенно в регионах, граничивших с тюркоязычным населением (Западная Армения, районы Вана, Муша), такие прозвища были нередки. Менее вероятна, но возможна связь с армянским словом «ерг» (երգ) — «песня». В таком случае Эрган мог быть певцом или весёлым человеком, но это скорее народная этимология, так как переход «ерг» в «эрг» нехарактерен для литературного армянского.

Географически фамилия Эрганян распространена среди потомков армян из Западной Армении, а также в среде армянской диаспоры. В России и странах постсоветского пространства она встречается реже многих других армянских фамилий, что говорит о сравнительно небольшом исходном роде или о поздней миграции. Сословного оттенка у фамилии нет: армянские фамилии на -ян носили и крестьяне, и ремесленники, и духовенство. Скорее всего, предок носителя фамилии был человеком с прозвищем Эрган, которое затем закрепилось за его потомками как родовое имя.