Фамилия Ермоенко — характерный пример восточнославянской модели образования на -енко. Этот суффикс, особенно распространённый в украинской ономастике, означает «маленький», «сын» или «потомок». То есть Ермоенко — это буквально «сын Ермоя» или «потомок Ермоя». В основе лежит личное имя Ермой, которое представляет собой народную, разговорную форму канонического имени Ермолай.

Имя Ермолай пришло на Русь из греческого языка (Ermolaos) и переводится как «вестник народа» или «глашатай». В крестьянской и мещанской среде это имя часто сокращали, переделывали на свой лад — так появились формы Ермол, Ермоха, Ермошка и, в том числе, Ермой. Фамилии на -енко от таких усечённых имён — явление обычное: они фиксируют не полное церковное имя, а то, как человека звали в быту.

Географически фамилия Ермоенко тяготеет к южным и центральным областям исторической России, где был силён украинский диалектный и фамильный тип. Чаще всего её можно встретить на территории современной Украины, в южных регионах России (Кубань, Ростовская область) и в Беларуси. Это объясняется тем, что суффикс -енко в XVI—XVIII веках активно вытеснял другие патронимические суффиксы на землях, входивших в состав Речи Посполитой, а затем и Малороссии.

Интересная деталь: в отличие от фамилий на -ов/-ев, которые часто указывали на принадлежность отцу (Иван Петров — сын Петра), фамилии на -енко могли обозначать не только прямого сына, но и более дальнего потомка, «внука» или «правнука». Поэтому Ермоенко — это не обязательно сын конкретного Ермоя, а скорее человек из рода, основатель которого носил это имя. Среди однокоренных «родственников» этой фамилии — Ермоленко, Ермошенко, Ермаков, но Ермоенко стоит особняком из-за редкой и короткой основы «Ермой», которая почти не встречается в других фамильных моделях.