Фамилия Ешкилева — редкий случай, когда основа, скорее всего, не русская, а тюркская, но оформлена типичным русским патронимическим суффиксом. Чтобы понять её происхождение, нужно отсечь окончание -а (женский вариант) и суффикс -ев, который указывает на принадлежность («чей?» — Ешкилев). Мужская форма — Ешкилев. В основе лежит личное имя или прозвище Ешка, Ешке.

Самая вероятная версия связывает это имя с тюркским корнем «еш» (друг, товарищ, ровня). В татарском, башкирском, казахском языках слово «иш» или «еш» означает «пара», «друг», «спутник», «помощник». Соответственно, Ешке — это ласкательно-уменьшительная форма, означающая «дружок», «товарищ», «ровня». Такие прозвища давали человеку, который был верным спутником, соратником, или же, по принципу «от противного», тому, кто постоянно искал компании. В тюркской среде имя Ешке или Ишке встречается, и от него по той же модели образованы фамилии Ешкин, Ишкин, Ешкеев.

Менее убедительна, но возможна связь с тюркским глаголом «ешке» (копать, рыть). В этом случае прозвище могло относиться к землекопу, рудокопу или человеку, который «роет носом», то есть усердно работает. Однако эта версия слабее, так как глагольные основы в прозвищах встречаются реже, чем именные.

Суффикс -ев указывает на то, что фамилия закрепилась в русской среде, скорее всего, через крещёных татар, башкир или представителей других тюркских народов, вошедших в состав Российского государства. Географически фамилия Ешкилевы встречается в Поволжье (особенно в Татарстане, Башкирии) и в соседних областях — Самарской, Оренбургской. Это подтверждает её восточные корни. По социальному происхождению носители фамилии могли быть как служилыми людьми (мурзы, татарская знать, перешедшая на русскую службу), так и государственными крестьянами из числа ясачных народов.

Таким образом, фамилия Ешкилева — это памятник межэтнического взаимодействия: тюркское по корню прозвище («дружок», «товарищ») было воспринято русской системой фамилиеобразования и закрепилось на карте России в районах тюркско-славянского пограничья.