Фамилия Естрина — женская форма, а мужская — Естрин. В русской традиции такие фамилии обычно строятся по модели «основа + суффикс -ин», указывающей на принадлежность: «чей сын?» — «Естрин». Суффикс -ин в русских фамилиях присоединяют к основам, оканчивающимся на -а или -я. Значит, в основе лежит имя или прозвище Естра.

Что такое Естра? Самый прямой путь — отчество от крестильного имени. В православных святцах есть имя Евстратий (в просторечии — Евстрат, Естрат). В бытовой речи, особенно в северных и центральных говорах, имя легко усекалось до Естра. Тогда Естрин — буквально «сын Естры», то есть потомок человека по имени Евстратий.

Но есть и вторая, менее очевидная, но живая версия. В русских говорах «естра» (или «ёстра») — диалектное название сестры. В некоторых областях говорили не «сестра», а «естра», «ёстра». Если прозвище Естра дали человеку, который постоянно опекал младших братьев и сестёр или был как-то особенно связан с сестрой, то фамилия Естрин могла возникнуть от этого прозвища. Такие случаи — от родственных прозвищ (Братов, Дядин, Сестрин) — в русской ономастике встречаются, хоть и реже, чем патронимы от имён.

Модель образования через суффикс -ин говорит о том, что фамилия закрепилась в среде, где было принято отвечать на вопрос «чей?». Это характерно для крестьянской и мещанской среды центральной России и Поволжья. Фамилия не дворянская и не семинарская (там преобладали бы формы на -ский или -ов). Скорее всего, предки носителя фамилии — люди из простонародья, получившие фамилию по имени или прозвищу отца в XIX веке, когда фамилии массово закреплялись за крестьянами после отмены крепостного права.

Таким образом, Естрин — это либо «сын Евстратия», либо «сын того, кого звали Сестрой» (прозвищем). Первая версия правдоподобнее, потому что опирается на устойчивую традицию сокращения канонических имён. Вторая — интересный региональный вариант, который мог бытовать локально.