Фамилия Евнуков — редкий случай, когда основа вызывает скорее недоумение, чем догадку. Сразу же возникает ассоциация с известным историческим термином «евнух», что порождает ироничные или даже оскорбительные толкования. Однако настоящий смысл фамилии лежит в другой плоскости, и разобраться в нём помогает анализ словообразовательной модели и знание старых русских прозвищ.

Ключ к разгадке — не в прямом значении слова «евнух», а в его диалектном или искажённом произношении. В русских говорах, особенно на северо-западе и в Поволжье, слово «евнух» могло звучать как «евну́к» или «явну́к». Но ещё интереснее версия, связывающая фамилию с древнерусским именем Евнутий или его просторечной формой Евнуха. В старину имя Евнутий (от греческого «эвнухос» — «охраняющий ложе») было редким, но вполне каноническим, его носили некоторые святые. Таким образом, Евнуков — это не «сын евнуха», а «сын Евнуха», то есть потомок человека, которого звали редким церковным именем.

Суффикс -ов указывает на классическую русскую патронимическую модель: Евнуков = сын Евнуха. Фамилия могла возникнуть в среде духовенства, где было принято давать детям необычные, часто греческие имена, либо в крестьянской среде, где имя могло быть переосмыслено и сокращено до прозвища. В пользу церковного происхождения говорит и то, что фамилии на -ский среди духовенства встречались реже, а простые патронимы на -ов были универсальны.

Встречается фамилия крайне редко, в основном в центральных регионах России и в Поволжье. Из-за созвучия с нарицательным словом носители фамилии в прошлом могли сталкиваться с насмешками, но этимологически она не несёт негативного смысла — это всего лишь указание на имя предка, которое со временем вышло из обихода.