Фамилия Евона — редкая, и её происхождение неочевидно. Главная загадка здесь — основа, которая не похожа на привычные русские корни.

Самый вероятный путь — это фонетическое изменение или запись на слух фамилии, восходящей к библейскому имени Ева. В русской традиции от женских имён фамилии образовывали редко, но если женщина была главой семьи (вдова, солдатка) или ребёнок был внебрачным, то имя матери могло стать фамилией. Форма «Евона» могла возникнуть из диалектного произношения: «Евоня» (уменьшительное от Ева) с добавлением суффикса -ин, который со временем редуцировался или был записан писцом как «а» на конце. Сравните с фамилиями Евин, Евкин — все они от одного корня.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с украинским или белорусским прозвищем «Евона», образованным от указательного слова «евонный» (его, принадлежащий ему). В говорах так могли назвать приёмного ребёнка или человека, который жил «при чужих», не имея своего хозяйства. Однако эта гипотеза слабее, так как в основе фамилий редко лежат местоимения.

Наконец, нельзя исключать нерусское происхождение. Фамилия могла быть русифицирована при переписи у греков, болгар или молдаван, где существует фамилия Eona или Evona, восходящая к греческому «эвон» (благозвучный) или имени Евон. В таком случае носители Евона — потомки переселенцев с Балкан, получившие русское окончание.

Точная география фамилии неизвестна из-за её редкости, но, судя по структуре, она бытовала в южнорусских и малороссийских губерниях, где женские фамилии на -а встречались чаще. Сословная принадлежность, скорее всего, крестьянская или мещанская — дворянских родов с такой фамилией в истории не зафиксировано.