Фамилия Эйдельзон — яркий пример ашкеназской фамилии, образованной от топонима, и в этом её главная особенность. Она принадлежит к группе фамилий на -зон, которые в немецкоязычной среде (а затем и в еврейской) означали «сын такого-то» или «родом из такого-то места». В данном случае основа «Эйдель» восходит к названию немецкого города Эйдель (Eydel) или к искажённому варианту названия города Эйделькау (ныне — Дзялдово в Польше). Таким образом, первый носитель фамилии, скорее всего, был выходцем из этого поселения или его окрестностей.

Суффикс -зон (от немецкого Sohn — «сын») в еврейских фамилиях Восточной Европы выполнял ту же роль, что и славянские -ов/-ев или -ин: он указывал на происхождение. В отличие от чисто немецких фамилий, где -зон часто присоединялся к личному имени отца (например, Мендельзон — сын Менделя), здесь мы видим привязку к месту. Это типично для фамилий, массово присвоенных еврейскому населению Российской империи в конце XVIII — начале XIX века, когда чиновникам было проще записать человека по названию города, откуда он прибыл, чем разбираться в местных прозвищах.

Географически фамилия Эйдельзон наиболее распространена среди евреев бывшей черты оседлости — на территории современной Украины, Беларуси, Литвы и Польши. Встречаются варианты написания: Эйдельсон, Эйдльзон, Айдельзон, что связано с особенностями произношения в разных диалектах идиша и с ошибками писарей при записи. Разница между -зон и -сон чисто фонетическая: в немецком языке буква «s» в суффиксе -sohn читается как «з», но при русификации часто передавалась через «с».

Стоит отметить, что в отличие от многих фамилий, где корень может быть тёмным или спорным, здесь этимология прозрачна. Споры могут идти лишь о том, какой именно топоним лёг в основу: помимо Эйделя и Эйделькау, существует несколько мелких населённых пунктов с похожими названиями в Пруссии и Австрийской Силезии. Однако сама модель — «фамилия от названия города» — сомнений не вызывает. Это не прозвище по профессии и не отчество, а географический маркер, который в XIX веке был одним из самых массовых способов дать фамилию переселенцам.