Фамилия Эюпова образована от восточного мужского имени Эюп, которое в переводе с арабского на русский язык означает «любимый». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Эюповых можно лишь на основании генеалогических исследований.