Фамилия Фарисеев происходит от названия религиозно-общественное течение в Иудее в эпоху Второго Храма — Фарисеи. Это одна из трёх древнееврейских «сект» или «философских школ», возникших в эпоху расцвета Маккавеев (II в. Само название «фарисеи» возникло в начале II века и впервые было использовано новообразовавшейся назарейской «сектой» по отношению к Мудрецам (прушим), после того как прушим отринули от себя назареев, впоследствии получившими название христиан. Слово «Фарисеи» является производным от ивритского корня‎, имеющего значение «отделяться», «обособляться», и означает «отделившиеся». Возможно это объясняется тем, что христиане считали, что прушим «отделились» от Иисуса Христа, поскольку не приняли его. Позже появилась версия, что название «фарисеи» связано с библейским повествованием о возвращении из вавилонского пленения: «И ели сыны Израилевы, возвратившиеся из переселения, и все отделившиеся к ним от нечистоты народов земли, чтобы прибегать к Господу Богу Израилеву» (Езд.6:21). Согласно этому объяснению, «отделение» началось размежеванием с иноплеменниками и продолжалось до «отделения» от невежд, причём католический мир особо хотел подчеркнуть, что именно фарисеи создали законы о ритуальной чистоте и нечистоте. Например, только у евреев можно было встретить такие фамилии, как Вейценбаум, что в переводе с немецкого означало «пшеничное дерево», Зауэрштром – «кислый поток», Левенфиш – «рыба-лев», Цигенбаум – «козье дерево», Квечман – «высказываться неохотно». Все это свидетельствует о том, что фамилия Фарисев представляет собой замечательный памятник европейской письменности и культуры. Однако процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения фамилии Фарисев можно лишь на основании генеалогических исследований.