Фамилия Фарунцев — одна из тех, где сразу бросается в глаза редкость основы. На слух она кажется иноязычной, и это первое, что стоит проверить. В русских фамилиях корень «фарун» не встречается в исконно славянских словах, поэтому логично предположить, что в основе лежит заимствованное имя или прозвище.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ев указывает на притяжательное значение «чей?» — то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Фарун. Если бы основа оканчивалась на твёрдый согласный, мы бы видели Фарунов, но -ев здесь стоит после мягкого или шипящего звука, что для русского языка нормально. Сама основа «Фарун» — это, скорее всего, адаптированная на русской почве форма восточного имени Фарух, Фарун или Фарухшах (в персидском и тюркских языках «фарух» означает «счастливый», «благословенный»). Такие имена нередко приносили в русские земли купцы, служилые люди или выходцы из татарских и кавказских родов.

Версия о происхождении от прозвища тоже имеет место, но менее вероятна. В русских говорах слова «фарун» нет, и придумать его в качестве бытового прозвища сложно — скорее, это именно личное имя, которое давали при крещении или которое бытовало в инородческой среде. Возможно, предок носителя фамилии был выходцем из мусульманских регионов, принявшим православие, или же имя попало в русский обиход через дипломатические и торговые контакты.

Географически фамилия Фарунцев редкая. Если судить по современным данным, она встречается в основном в центральной России и Поволжье, что косвенно подтверждает связь с татарским или башкирским влиянием — именно там чаще всего оседали носители тюркских имён, переходившие в православие. Суффикс -ев, а не -ов, может указывать на то, что основа в момент образования фамилии произносилась с мягким «н»: Фарунь, откуда и пошло Фарунцев.

В словарях Б. Унбегауна и В. Никонова фамилия не упоминается как распространённая, что подтверждает её штучный характер. Это не массовая крестьянская фамилия, а скорее родовая, возникшая в конкретной семье, возможно, в XVI–XVII веках, когда на Руси активно шёл процесс адаптации инородческих имён. Таким образом, Фарунцев — это фамилия-свидетельница межкультурного обмена, где восточное имя «счастье» закрепилось в русской патронимической форме.