Фамилия Фененець — очень редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, это украинская фамилия, на что указывает суффикс -ець. В украинской ономастике этот суффикс часто встречается в фамилиях, образованных от прозвищ или названий местности, и может указывать на принадлежность к чему-либо или происхождение откуда-либо. Основа фамилии — Фенен — заставляет искать корни в личном имени или прозвище.

Наиболее вероятная версия связывает фамилию с разговорной формой крестильного имени Феодор (в украинском произношении — Хведь, Федь, Феня). Форма Фенен могла возникнуть как ласкательное производное от «Феня» с помощью суффикса -ен (сравните: Федя — Феденя, Сеня — Сененко). Тогда Фененець — это «сын или потомок Фенена», то есть маленького Феди или Федора. Подобная модель образования (имя + суффикс -ець) характерна для западноукраинских земель, особенно для Галичины и Волыни.

Менее вероятная, но возможная версия — прозвищное происхождение. В украинских диалектах слово «феня» могло означать нечто хрупкое, слабое или, наоборот, капризное (от «фенить» — манерничать, жеманиться). В таком случае Фененець — это потомок человека, которого прозвали Фененом за какой-то заметный недостаток или особенность характера. Однако, учитывая редкость фамилии, имя-основа выглядит убедительнее.

Географически фамилия Фененець почти не встречается за пределами Украины. По данным современных интернет-ресурсов, единичные носители живут в западных областях — Тернопольской, Ивано-Франковской. Это подтверждает гипотезу о её локальном, возможно, даже хуторском происхождении: предки носителя фамилии, скорее всего, были крестьянами или мещанами из небольшого села, где прозвище или имя Фенен закрепилось за целым родом.

В дореволюционных списках и метрических книгах фамилия почти не фиксируется, что говорит о её позднем оформлении — вероятно, в XIX веке, когда фамилии активно давали бывшим крепостным. Фененець — типичный пример «гнездовой» фамилии, которая не разошлась широко, а осталась в пределах одной семьи или нескольких родственных дворов.