Фамилия Фляжникова образована от прозвища Фляжник, которое восходит к слову «фляга». Флягой в старину назывался не только специальный плоский дорожный сосуд для питья, но и любая бутылка, склянка, баклажка. Таким образом, можно предположить, что прозвище Фляжник получил человек, занимавшийся продажей стеклянной или другой посуды, или же тот, кто был пристрастен к фляжке, к бутылке с хмельными напитками. В старину к людям, любившим выпить, не всегда относились предосудительно. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Фляжник, со временем получил фамилию Фляжникова.