Фамилия Фофлина хранит память о личном имени или прозвище дальнего предка, и в её основе лежит просторечная форма Фофля. Чаще всего это имя возводят к церковному Фофан, то есть к каноническому Феофану, который пришёл на Русь из греческого языка. Греческое Theophanes переводится как «богоявленный», и в этом случае фамилия оказывается в ряду многочисленных «богоявленских» фамилий, только в неожиданном народном обличье.

Словообразовательная модель здесь простая и показательная: суффикс -ин указывает на принадлежность, отвечая на вопрос «чей?». Фофлина — это дочь или жена Фофли, а изначально — вся семья, вышедшая из двора человека по прозвищу или имени Фофля. Такая модель типична для северных и центральных русских говоров, где краткая форма имени легко становилась основой фамилии.

Скорее всего, основатель рода Фофлиных принадлежал к простому сословию. Имена вроде Фофан, Фофля бытовали в крестьянской и посадской среде, где церковное Феофан перекраивалось на свой лад, сокращалось до одного слога и обрастало ласкательными или бытовыми окончаниями. Это не признак неграмотности, а живая традиция народной речи, которая упрощала непривычные греческие звучания.

Есть и вторая версия происхождения. Прозвище Фофля могли дать человеку не по имени, а по характеру. В русских говорах слово «фофан» означало «простак, бесхитростный человек». Если предок получил такое прозвище за простодушие или наивность, то фамилия Фофлина закрепила за его потомками память об этой черте. Обе версии не противоречат друг другу: имя и прозвище могли существовать параллельно, а народная этимология легко связывала их в одно целое.

В написании фамилии есть любопытная деталь: в современном виде она выглядит как Фофлина, хотя исходная основа Фофля при склонении давала бы формы вроде Фофлиной без изменения корня. Здесь мы видим, как фамилия застыла в женской форме, что типично для случаев, когда речь идёт о женщине — носительнице фамилии, или когда фамилия передавалась через женскую линию. В мужском варианте она звучала бы как Фофлин, и оба варианта встречаются в документах.

Таким образом, за фамилией Фофлина стоит либо крещёное имя Феофан в его народной форме, либо меткое прозвище простака. В любом случае, это фамилия с ярким разговорным оттенком, которая выдаёт свои корни в живой русской речи, а не в книжной традиции.