Фамилия Фондейкина — редкий случай, когда написание подсказывает разгадку быстрее, чем звучание. Если произнести её на слух, первым делом вспоминается «фундейка» или «фондейка» — так в некоторых русских говорах называли затейливую вещицу, безделушку или, по другой версии, нечто шаткое, ненадёжное. Но буква «о» в корне (Фондейкин, а не Фундейкин) выдаёт книжное, а не народное происхождение.

Скорее всего, перед нами прозвище от диалектного глагола «фондить» или «фондовать» — в рязанских и тамбовских говорах это означало «хитрить», «лукавить», «притворяться». Человека, который любил прибедняться или обманывать для выгоды, могли прозвать Фондей. Суффикс -ей- здесь типичен для русских прозвищ (сравните: Лентяй, Бродяй, Гуляй), а фамильный суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Фондейкин, то есть сын или потомок Фондея.

Версия с «безделушкой» (фондейкой) тоже возможна, но слабее: прозвища по предметам быта обычно давали мастерам, которые эти предметы делали. Однако ни «фондейщик», ни «фондейный мастер» в ремесленных списках не зафиксированы. А вот прозвище по характеру — самая ходовая модель в русской антропонимии.

Географически фамилия тяготеет к югу России: Рязанская, Тамбовская, Воронежская области. В дореволюционных метрических книгах Фондейкины встречаются редко, что подтверждает локальный и поздний характер фамилии — скорее всего, она оформилась уже в XVIII–XIX веках, когда крестьянам начали массово давать фамилии по уличным прозвищам.

В написании возможна путаница с немецкой фамилией Фондейк (von Deich — «с дамбы»), но русский суффикс -ин и отсутствие дворянского «фон» в документах исключают западное происхождение. Так что корни у Фондейкиной чисто русские, деревенские, и предок её — человек себе на уме, хитроватый и изворотливый.