Фамилия Фоничкин — один из тех редких случаев, когда основа ясна, а модель образования необычна и сразу бросается в глаза. В ней слышится что-то уменьшительное, почти игровое, и это не случайно.

Корень фамилии — имя или прозвище Фоничка. Это народная, ласкательная форма от канонического имени Афанасий. В разговорной речи имя Афанасий прошло через цепочку сокращений: Афоня → Фоня → Фоничка. Уменьшительный суффикс -ичк- придаёт имени оттенок нежности или, в некоторых говорах, ироничной фамильярности. Таким образом, Фоничкин буквально означает «сын Фонички», то есть потомок человека, которого в быту звали этой уменьшительной формой.

Модель образования фамилии — притяжательное прилагательное с суффиксом -ин, что типично для русских фамилий от основ на -а/-я. Но если большинство фамилий на -ин образовано от имён вроде Фомин, Ильин, то здесь исходная форма — не Фоня, а именно Фоничка. Это редкий случай, когда в основе лежит не просто краткое имя, а его дальнейшая, более «мелкая» модификация. Такие фамилии встречаются реже и часто указывают на то, что прозвище закрепилось в семье именно в этой ласкательной форме, возможно, от материнского обращения к ребёнку.

В ономастических справочниках, например в работах Б. Унбегауна, фамилии на -ичкин выделяются как продукт народной речи, характерный для центральных и северных областей России. Географически Фоничкины могли быть связаны с крестьянской средой, где уменьшительные имена были нормой общения. Сословный состав — скорее всего, крестьяне или мещане, поскольку дворянские фамилии редко образовывались от таких «домашних» вариантов.

Стоит отметить, что существует и альтернативная, хотя и менее вероятная, версия: от прозвища Фоничка, данного человеку с каким-то внешним или поведенческим сходством — например, с фыркающим звуком («фонить» в диалектах могло означать «издавать глухой звук»). Но связь с именем Афанасий настолько прямая и типичная для русского именослова, что она остаётся основной.