Фамилия Фубенчуков встречается редко, и её происхождение не лежит на поверхности. В ней сразу заметна нехарактерная для русских фамилий основа «Фубенч-», которая наводит на мысль о заимствовании или иноязычном корне. При этом типичный русский суффикс -ов указывает на то, что фамилию адаптировали на славянской почве: скорее всего, её принесли в русскую среду выходцы из других регионов.

Скорее всего, в основе лежит прозвище или имя, связанное с тюркскими или кавказскими языками. Корень «Фубен» может восходить к слову, означающему «сильный», «крепкий» или «воин» (ср. с некоторыми тюркскими антропонимами, где встречается звукосочетание «фу»). Вторая часть «чук» — это распространённый тюркский уменьшительный или принадлежащий суффикс, который часто добавляли к именам и прозвищам. Таким образом, «Фубенчук» могло быть прозвищем вроде «маленький Фубен» или «сын Фубена». А уже от него в русской среде по модели «чей?» образовали фамилию Фубенчуков — «сын Фубенчука».

Другая, менее вероятная версия связывает фамилию с украинским или белорусским ареалом. Там суффикс -чук (как в фамилиях Ковальчук, Шевчук) очень продуктивен, и он мог прирасти к основе «Фубен». Однако в таком случае форма «Фубенчуков» выглядит как вторичная русификация: исходная фамилия была бы Фубенчук, а при переезде в центральные губернии к ней добавили -ов. Но в украинском языке основа «Фубен» не имеет очевидных корней, поэтому тюркское происхождение выглядит убедительнее.

Географически фамилия почти не встречается в исторических документах и современных справочниках. Это говорит о том, что она могла быть единичной — то есть принадлежать одному роду, который не дал массового распространения. Носители, вероятно, происходят из регионов, где контактировали русские и тюркские народы (Поволжье, Приуралье, Северный Кавказ). Сословно это могли быть казаки, однодворцы или крестьяне, получившие фамилию по прозвищу предка.

Точных сведений о знаменитых носителях фамилии Фубенчуков нет. Это не умаляет её ценности: такие редкие фамилии — живые свидетельства давних этнических и языковых контактов, которые редко попадают в словари.