Фамилия Фудун — редкая и сразу приковывает внимание необычным звучанием. В русской ономастике она стоит особняком, и её происхождение — скорее всего, не славянское, а пришлое. Чтобы понять корни, нужно отбросить привычную модель «основа + суффикс -ов/-ин», которой в фамилии Фудун нет. Это либо прозвище, застывшее в форме именительного падежа (как у фамилий Коваль, Соловей), либо адаптированная иноязычная фамилия.

Наиболее вероятная версия — молдавское или румынское происхождение. В румынском языке слово «fudul» означает «гордый», «надменный», «спесивый». Фамилия Фудун могла возникнуть как прозвище, данное человеку с таким характером. Окончание «-ун» в румынских фамилиях встречается (ср. Каракун, Паладун) и часто усиливает значение корня. Если предки носителя фамилии были выходцами из Бессарабии или Молдавии, где румынские говоры были распространены, эта версия становится основной.

Вторая гипотеза, менее вероятная, но возможная — тюркские корни. В некоторых тюркских языках «фудун» могло означать «бродяга» или «беглец» (от слова «fudu»). Однако такая лексика редко становилась основой для фамилий, чаще — для прозвищ. Кроме того, фамилия Фудун не фиксируется в классических списках тюркских родов, что делает эту версию спорной.

Географически фамилия встречается в России крайне редко, в основном на юге — в Краснодарском крае, Ростовской области, а также среди русскоязычных в Молдавии. Это подтверждает связь с регионом, где смешивались славянские, романские и тюркские влияния.

Сословная принадлежность предков-носителей фамилии не прослеживается: среди дворян Фудунов нет, в купеческих гильдиях они не числились. Скорее всего, это фамилия крестьян или мещан, получивших прозвище по характеру или внешности. Письменных упоминаний фамилии в дореволюционных источниках почти нет — это говорит о её локальном бытовании и поздней фиксации (в советских паспортах).

Таким образом, Фудун — фамилия-прозвище, скорее всего молдавского происхождения, означавшая «гордец». Носитель этой фамилии может с высокой вероятностью найти корни в Бессарабии или на юге Российской империи, где жили выходцы из румыноязычных земель.