Фамилия Фидун — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа не вписывается в привычные модели русских фамилий, образованных от крестильных имён или названий профессий. В ней нет суффикса -ов/-ев, -ин или -ский, что сразу указывает: перед нами, скорее всего, фамилия, закреплённая в форме прозвища или адаптированная из другого языка.

Самая правдоподобная версия связывает Фидун с тюркскими корнями. В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) слово «фидун» или близкое к нему может означать «непоседа», «беспокойный человек», «ерш» — прозвище для подвижного, неусидчивого или даже вздорного человека. Такие прозвища в XVI–XVII веках нередко становились фамилиями у крестьян и служилых людей, особенно в Поволжье и Приуралье, где русское население тесно контактировало с тюркским. Суффикс -ун в русском языке тоже активен: он образует имена деятеля (бегун, ворчун, говорун), поэтому Фидун могло быть чисто русским прозвищем от глагола «фидить» — диалектного слова, означавшего «суетиться», «беспокоиться». Правда, этот глагол редок и плохо засвидетельствован в письменных источниках, что делает тюркскую версию более надёжной.

Есть и альтернативное объяснение: Фидун — искажённое Федот или Федул. В южнорусских и украинских говорах звук «т» между гласными мог переходить в слабое «д» или выпадать, а «л» на конце — в «н». Так Федун (от Федул) мог превратиться в Фидун. Но эта версия слабее: обычно такие изменения затрагивают более распространённые формы (Федот — Федотин), а не дают новую фамилию с нуля.

География фамилии сегодня размыта. Встречается она у русских, украинцев, а также у крымских татар и народов Кавказа, что подтверждает её тюркские или восточные корни. В дореволюционных метрических книгах Фидуны фиксировались в Таврической губернии и на Кубани — регионах, где смешивались славянские и тюркские фамильные традиции.

Сословная принадлежность по фамилии не определяется: Фидун мог быть и крестьянином, и казаком, и мещанином. Прозвище, лёгшее в основу, указывает на черту характера, а не на род занятий. Известных носителей с громкими титулами или званиями нет — фамилия осталась в тени истории, что для этимолога только плюс: её разбор опирается на язык, а не на биографии.