Фамилия Фунатова — женская форма, а мужская, Фунатов, образована от прозвища или мирского имени Фунат. В основе почти наверняка лежит диалектное слово «фунт» или производное от него, но с характерной южнорусской или украинской заменой «н» на «м» — явление, известное в ономастике как мена сонорных. В говорах «фунат» могло означать нечто увесистое, тяжеловесное, либо человека, который «весит фунт», то есть крепкого, плотного. Вторая версия, менее вероятная, но не исключённая — связь с тюркским корнем «фунат» (от «фун» — светлый, ясный), однако для русской фамилии такая основа редка, и географическое распространение указывает скорее на славянскую почву.

Суффикс -ов- типичен для русских фамилий, образованных от прозвищ или имён на твёрдый согласный. Форма Фунатова с окончанием -а указывает на принадлежность к роду: «дочь (или жена) Фунатова». В документах XVII–XVIII веков, если копнуть в переписи, можно встретить крестьян или посадских людей с прозвищем Фунат — чаще в рязанских, тамбовских и воронежских землях, где диалектная замена «м» на «н» встречается в словах вроде «фунат» вместо «фунт». Фамилия не относится к числу древних боярских или дворянских — её носители, скорее всего, были из крестьянской или мещанской среды, а само прозвище могло закрепиться за человеком, торговавшим на вес или отличавшимся дородностью.

Интересная деталь: в русских фамилиях на -атов/-ятов часто путают с патронимами от канонических имён (вроде Феофанов — от Феофан), но Фунатов стоит особняком. Никакого святого Фуната в православных святцах нет, так что это чисто бытовое, прозвищное образование. Встречается фамилия и в написании с одной «н» — Футатов, но это уже результат описки или местного произношения. Для носителя фамилии Фунатова важно помнить: её корень — не в экзотике, а в повседневной жизни предков, где вес и мера были делом обычным.